অর্থ লোপাট ও তার তথ্য গোপন নিয়ে তোপের মুখে থাকা আতিউর মঙ্গলবার সকালে প্রধানমন্ত্রীর কার্যালয়ে গিয়ে পদত্যাগপত্র জমা দেন।
পরে প্রধানমন্ত্রীর প্রেসসচিব ইহসানুল করিম সাংবাদিকদের বলেন, “বাংলাদেশ ব্যাংকে একটি অনাকাঙ্ক্ষিত ঘটনার কারণে উদ্ভূত পরিস্থিতির পরিপ্রেক্ষিতে গভর্নর আতিউর রহমান সকালে প্রধানমন্ত্রীর কার্যালয়ে সাক্ষাৎ করে পদত্যাগপত্র পেশ করেছেন। প্রধানমন্ত্রী এ পদত্যাগপত্র গ্রহণ করেছেন।”
প্রধানমন্ত্রী শেখ হাসিনা পদত্যাগপত্র গ্রহণ করে বলেন, ‘ড. আতিউর রহমানের এ পদত্যাগ একটি সাহসী পদক্ষেপ। যা নৈতিক মনোবল ও সৎ সাহসের বিরল দৃষ্টান্ত হয়ে থাকবে।’
দেশের অর্থনৈতিক উন্নয়নে ড. আতিউরের অনেক অবদান রয়েছে উল্লেখ করে প্রধানমন্ত্রী বলেন, ‘বিশেষ করে তার সময়ে রিজার্ভ বৃদ্ধি ও ব্যাংকিং সেবাখাত আরও গতিশীল হয়েছে।’